
DNA에서 벌어지는 줄다리기: 헌팅턴병 반복서열은 어떻게 늘고 줄까
스위스에서 나온 새로운 연구가, 헌팅턴병 유전자 속 CAG 반복 횟수가 우리 세포 안에서 어떻게 늘거나 줄 수 있는지에 대한 단서를 제공해.
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헌팅턴병(HD) 대규모 유전학 연구에서 CAG 확장이 길수록 증상이 더 일찍 나타난다는 사실이 밝혀진 이후로, 반복서열 길이가 중요하다는 건 이미 알려져 왔어. 최근 연구는 특히 취약한 뇌세포 안에서 그 반복서열 길이가 어떻게 늘어나는지—대략 CAG 50개 수준에서 천 개를 넘는 수준까지—를 부각시켰지.
이런 확장이 어떻게 일어나고 질병에 어떤 영향을 미치는지 이해하는 건, 적절한 치료 전략을 개발하는 데 매우 중요해. 영향을 받은 세포에서 확장된 DNA를 바로잡을 수 있을까? 음… 어쩌면 세포가 스스로 해낼 수도 있어!
분자 수준 줄다리기의 선수들
DNA 수리 유전자들은 HD 증상이 언제 시작되는지에 강력한 영향을 줄 수 있어. 수년 동안 연구자들은 이렇게 물어왔지. 이 유전자들이 HD를 일으키는 결함 있는 DNA 구간에 실제로 무슨 일을 하는 걸까? 그리고 이 지식을 활용해서 증상 시작을 늦출 수 있을까—어쩌면 질병이 아예 발병하지 않을 정도로 충분히?
Petr Cejka 연구팀이 Nature Communications에 발표한 새 연구는, 우리 세포 안에서 서로 반대되는 두 DNA 수리 팀이 어떻게 분자 하나하나 수준에서 경쟁하는지 재구성했어. 한 팀은 고치려는 과정에서 실수로 CAG 반복을 늘리고, 다른 팀은 그것을 다시 잘라 줄여. 이 세련된 생화학적 분석은 MSH3, MLH3, FAN1 같은 인자들이 왜 발병 시점에 그렇게 큰 영향을 미치는지 마침내 보여주고, HD를 늦추거나 심지어 예방할 새로운 길도 열어줘.
HD에서 DNA 수리가 중요한 이유
DNA는 세포핵에 이중 나선 형태로 저장돼 있고, 각 가닥의 글자(염기)는 지퍼의 맞물리는 톱니처럼 정확하게 짝을 이뤄.

하지만 헌팅틴(HTT) 유전자에서 CAG 서열이 너무 길어지면, 두 가닥이 더 이상 완벽하게 맞춰지지 않아. 한쪽에 ‘톱니’가 여분으로 생기면서 나선에서 불룩 튀어나오는 불일치가 생길 수 있는데, 과학자들은 이를 extrusion loop라고 불러(한쪽이 꼬인 지퍼를 떠올리면 돼!).
누구나 HTT 유전자에 어느 정도 CAG 반복을 물려받지만, 일반적으로 40개 이상이면 결국 병이 발병해. 반복이 더 길어지면 DNA가 깔끔하게 ‘지퍼처럼’ 닫히지 못하고, 세포의 수리 기계가 달려들어 고치려 해. 그리고 여기서 줄다리기 게임이 시작돼. 수리는 두 방향으로 갈 수 있어. 어떤 단백질 복합체는 문제를 매끈하게 정리해 DNA를 안정화시키지만, 다른 것들은 실수로 반복을 점점 더 길게 만들어 버리지.
“확장 팀”: MutSβ와 MutLγ
DNA 수리는 보통 맞춤법 검사기처럼 작동해서, DNA가 복제될 때 생기는 오류나 불일치, 작은 루프를 찾아내. 그런데 HD에서는 수리 팀의 일부가 오히려 문제를 만들어 버려.
같은 반복서열을 두고 두 DNA 수리 경로가 말 그대로 줄다리기를 하는 셈이야. 어느 쪽이 이기느냐가, 특정 세포에서 CAG가 늘지 줄지를 결정할 가능성이 커.
두 복합체—MutSβ(MSH2 + MSH3로 구성)와 MutLγ(MLH1 + MLH3)—는 CAG 반복이 많을 때 생기는 extrusion loop를 인식해. 그런데 이 루프를 제거하는 대신, 확장 팀은 루프를 본보기(템플릿)로 삼아 CAG를 추가로 채워 넣어. 결과는? 반복서열이 더 길어져. MutSβ와 MutLγ는 정상적인 수리 작업을 CAG 수를 늘리는 ‘복사-붙여넣기’ 실수로 바꿔 버리는 거야.
“수축 팀”: FAN1의 구조 활동
여기서 FAN1이 등장해. FAN1은 뉴클레아제로—본질적으로 분자 가위 한 쌍 같은 단백질이야—정반대의 일을 할 수 있어. FAN1은 이런 DNA 루프를 인식해 문제 부위를 직접 잘라내. 보조 단백질들과 함께 FAN1 팀은 새로운 반복을 더하는 대신, 여분의 반복을 제거하지.
FAN1에는 똑똑한 두 번째 수가 있어. MutLγ가 MutSβ와 짝을 이루지 못하게 물리적으로 막아, 확장 기계가 시작도 하기 전에 멈추게 하거든.
분자 수준의 줄다리기

연구팀은 시험관에서 두 반응을 나란히 설정함으로써, 같은 HTT 반복서열에서 두 DNA 수리 경로가 실제로 줄다리기를 벌인다는 걸 보여줬어. 어느 쪽이 이기느냐가, 특정 세포에서 CAG가 늘지 줄지를 결정할 가능성이 커.
생화학과 인간 유전학을 잇다
DNA 수리 유전자가 증상 발현 시점에 영향을 준다는 발견은 갑자기 나온 게 아니야. 수천 명의 HD 환자가 기증한 DNA 샘플 덕분에 가능해진 전장유전체 연관 분석(GWAS)에서 시작됐지. 이 대규모 연구들은 발병 연령을 바꾸는 유전적 변이를 찾기 위해 전 유전체를 훑었어. 메시지는 분명했지. MSH3, MLH3, FAN1처럼 DNA 수리에 관여하는 유전자들이 핵심이라는 거야.
이번 새 생화학 모델은 GWAS 신호가 왜 수리 유전자를 가리키는지 이유를 아주 깔끔하게 설명해. MutSβ나 MutLγ 활성을 높이는(MSH3 또는 MLH3의) 변이는 CAG 확장을 가속해 증상을 더 일찍 오게 만들고, FAN1 활성을 강화하는 변이는 확장을 늦춰 발병을 지연시킬 수 있어.
과학자들은 이런 상관관계를 오래전부터 봐 왔지만, 이제 Cejka 연구팀의 분자 재구성 덕분에 인간 유전학과 헌팅턴병을 움직일 수 있는 실제 DNA 화학을 마침내 연결할 수 있게 됐어.

이것이 중요한 이유
이 정밀한 메커니즘을 이해하는 건 단지 흥미로운 생물학을 넘어, 우리가 치료제를 어떻게 개발할 수 있을지 보여주는 로드맵이야. 수축이나 안정화 쪽으로 균형을 기울일 수 있다면, 질병 진행 자체를 늦추거나 멈출 수도 있어.
이미 몇몇 회사들이 이 아이디어를 추진 중이야:
- MSH3를 표적하는 ASO나 MutSβ 억제제는 확장 활성을 낮추는 것을 목표로 하며, Ionis Pharmaceutical, LoQus23 Therapeutics, Pfizer에서 개발 중이야.
- Harness Therapeutics는 FAN1 기능을 강화하거나, MutLγ에 대한 FAN1의 차단 효과를 모방하려 하고 있어. 이는 HTT가 통제 불능으로 확장되는 것을 막는 또 다른 경로가 될 수 있어.
다음은 무엇인가요?
강한 증거는 체세포 반복 확장이 증상 시작 시점을 좌우한다고 시사하지만, 이는 아직 작업 가설이야. 연구자들은 이제 이런 수리 과정이 뇌의 각 세포 유형에서 어떻게 다른지, 그리고 살아 있는 조직 안에서 어떻게 상호작용하는지를 지도처럼 그려보려 하고 있어.
세포가 스스로 DNA 오류를 자연스럽게 바로잡는 방법을 배우는 건, 헌팅턴병을 ‘세포 내부에서부터’ 고치게 하는 치료법에 영감을 줄 수 있어.
핵심 과제는 균형이야. 때로는 HTT 반복을 길게 만들기도 하는 같은 DNA 수리 시스템이, 우리 유전체의 나머지 부분을 보호하는 역할도 하거든. 궁극적인 목표는 다른 곳의 DNA 무결성을 해치지 않으면서 CAG 확장을 억제하도록 이 경로들을 정밀하게 조율하는 거야.
이 모델이 맞다면, 완전히 새로운 치료 접근이 열릴 수 있어—DNA 수리 자체를 표적으로 삼아 헌팅턴병을 늦추거나 심지어 예방하는 거지.
요약
- HD 발병 시점은 DNA 수리에 관여하는 유전자들의 영향을 크게 받아.
- MutSβ(MSH2–MSH3)와 MutLγ(MLH1–MLH3)는 협력해 CAG DNA에 절개를 내고, 반복을 더 추가해.
- 반대로 FAN1과 그 팀은 CAG 루프를 잘라 과잉 반복을 제거해. FAN1은 또 MutSβ–MutLγ의 결합을 막아 확장을 예방하기도 해.
- 이처럼 서로 반대되는 반응은, FAN1을 강화하거나 MLH3/MSH3 활성을 낮추면 HD 발병 시점을 늦출 수 있는 이유를 설명해.


